Theo Bộ Tài chính, việc miễn thuế hàng hóa NK phục vụ dự án của tổ chức, cá nhân nhập khẩu ủy thác hoặc trúng thầu NK hàng hóa cung cấp cho đối tượng miễn thuế NK theo Điều ước quốc tế, tại khoản 21 Điều 103 Thông tư 38/2015/TT-BTC thì "hàng hóa nhập khẩu được miễn thuế NK theo Điều ước quốc tế" thuộc đối tượng miễn thuế NK.

Do đó, trường hợp tổ chức, cá nhân NK uỷ thác hoặc trúng thầu NK hàng hoá (giá cung cấp hàng hoá theo hợp đồng uỷ thác hoặc giá trúng thầu theo quyết định trúng thầu không bao gồm thuế NK) để cung cấp cho các đối tượng được hưởng ưu đãi miễn thuế NK theo Điều ước quốc tế thì cũng được miễn thuế NK đối với hàng hoá NK uỷ thác, trúng thầu.

Về việc đăng ký Danh mục hàng hóa miễn thuế NK, theo Bộ Tài chính, để tạo thuận lợi cho DN, Thông tư 38/2015/TT-BTC quy định hàng hóa NK theo Điều ước quốc tế thuộc đối tượng miễn thuế NK, không phải xét miễn thuế nhưng phải đăng ký Danh mục hàng hóa miễn thuế với cơ quan Hải quan.

Trong điều kiện thời gian thực hiện gấp, Liên doanh đã ký hợp đồng ủy thác, hàng hóa đã về đến cảng nhưng chưa đăng ký Danh mục miễn thuế, Bộ Tài chính giao Cục Hải quan tỉnh Bà Rịa-Vũng Tàu xử lý miễn thuế đối với số hàng hóa NK thuộc đối tượng miễn thuế theo Hiệp định giữa Chính phủ CHXHCN Việt Nam và Chính phủ Liên bang Nga về việc tiếp tục hợp tác trong lĩnh vực thăm dò địa chất và khai thác dầu khí, nhưng chưa đăng ký Danh mục miễn thuế theo quy đinh. Sau khi hoàn thành thủ tục NK cho số hàng hóa nêu trên, Liên doanh có trách nhiệm báo cáo cụ thể số lượng hàng hóa thực tế nhập khẩu để Cục Hải quan tỉnh Bà Rịa-Vũng Tàu trừ lùi theo quy định